Bereits die Formulierungen, die für die Beschneidung oft genutzt wird, machen jedoch deutlich, wie stark zwischen der weiblichen und männlichen Beschneidung unterschieden wird – so wird die weibliche Beschneidung oft als "weibliche Genitalverstümmelung" bezeichnet, ein Begriff, der bei der Einordnung der männlichen Beschneidung von offizieller oder sachverständiger Seite nur selten genutzt wird.

Derartige Empfehlungen führen bei Kritikern oft dazu, dass denjenigen, die die weibliche Beschneidung als per se barbarisch ansehen, die männliche jedoch sogar empfehlen, dies als eine Art modernes Herrendenken interpretieren. So wird einerseits den Völkern, die noch die weibliche Beschneidung, egal in welcher Form, praktizieren, der Vorwurf gemacht, sie würden ohne Not, lediglich aus Tradition oder Religion heraus, an den Geschlechtsorganen von Kindern Veränderungen vornehmen, was barbarisch sei und auch tief in die späteren Möglichkeiten des Auslebens der Sexualität eingreife; während zur gleichen Zeit bei der Beschneidung von Jungen derartige Praktiken sogar als erwünscht und nicht zuletzt verantwortungsvoll hinsichtlich der Körperhygiene usw. definiert wird. Diese Inkonsequenz, so Kritiker, zeigt auf, dass hier letztendlich den Völkern, gerade auch in Afrika, das Denken der westlichen Welt aufgezwungen werden soll, gleichgültig ob dies logisch nachvollziehbar ist oder nicht.